定量蛋白質組學

Quantitative Proteomics

定量蛋白組學是蛋白質組學的一個重要組成部分，即對一套基因組表達的全體蛋白或某一復雜的混合物體系中所有蛋白質進行定量和鑒定。

常用的定量蛋白質組學的研究方法有如下三種：

Label-free 非標記定量技術，不對樣本做化學試劑標記，直接比較特定肽段/蛋白質在不同樣品間的色譜質譜響應信號，獲得樣品間蛋白質表達量的變化。適合臨床大樣本例數分析，得到初、中級蛋白質定性覆蓋率。

iTRAQ/TMT 定量技術，通過特異性標記多肽的氨基基團，可同時比較4種至10種不同樣本蛋白質表達量的變化。不同樣本標記后混合樣品，統一進行液相分離質譜檢測分析，減少了上機實驗誤差，適合小樣本例數分析，得到中、高級蛋白質定性覆蓋率。

SWATH/DIA 定量技術，該技術首先建立譜圖庫，然后無遺漏、無差異地獲得樣本中所有離子的全部碎片信息。無需指定目標肽段，掃描點數均勻，利用譜圖庫即可實現定性確證和定量離子篩選，并可實現數據回溯。將標志物篩選與初步驗證過程合二為一。適合臨床大樣本例數分析，得到中、高級蛋白質定性覆蓋率。

實驗流程

樣本要求

血清或者血漿100ul，尿液5ml，動物或人組織200mg，微生物/細胞10?拷貝，干冰冷鏈運輸

檢測平臺

納升高效液相色譜高分辨軌道離子阱質譜儀Nano High Performance Liquid Chromatography Q Exactive Obitrap Mass Spectrometer（NanoHPLC-QE）

報告提交內容

樣本處理條件，儀器設定參數，實驗原始數據，定性定量分析結果，蛋白質功能GO分析結果。